11種腫瘤類型癌變過程中的表觀遺傳調控，PCR-Clean助力科研

核酸相關研究需要對環境中的核酸污染進行控制，以確保實驗結果的穩定和實驗數據的準確。德國MB公司的核酸污染祛除試劑——PCR Clean，即用型核酸污染清除試劑，高效清除DNA、RNA及核酸酶的干擾。

染色質去濃縮，以及與隨后的轉錄機制結合的時空動力學，在癌癥的發病轉變(如起始、進展和轉移)中具有重要但尚未了解的作用。

表觀遺傳調控影響基因表達、譜系測定、細胞-細胞相互作用和治療耐藥性。與體細胞突變等遺傳驅動因素相比，表觀遺傳驅動因素的定義不太明確。然而，它們可能通過富集類型的分析來識別，類似于發現驅動基因的方式。了解它們與遺傳和環境因素的相互作用也至關重要。最近證實了KRAS突變和胰腺上皮組織損傷之間的相互作用，這種相互作用重塑了染色質，產生了有利于癌癥的轉錄活性。

科研人員認為表觀遺傳驅動因素是與癌癥發生、進展和轉移相關的調控元件或轉錄因子(tf)的活性，通常通過與遺傳驅動因素的相互作用。有可能這種表觀遺傳驅動可以解釋以前未知的致瘤機制。

轉座酶可及染色質測序(ATAC-seq)是一種快速、靈敏的表觀基因組分析方法。先前的研究已經獲得了一些癌癥的ATAC-seq結果，其總體水平是腫瘤內不同細胞類型的平均值。

最近單核ATAC-seq (snATAC-seq)的發展為檢查單細胞表觀基因組提供了更大的分辨率。將snATAC-seq與單核RNA測序(snRNA-seq)結合，可以同時分析同一細胞的表觀基因組和轉錄組，從而直接分析染色質可及性和基因轉錄之間的關系。我們構建了從200多例患者中獲得的11種主要癌癥類型的綜合多基因組圖譜。大量的樣本和相當多的癌癥類型和狀態(例如，正常、原發性和轉移性)的代表性為研究癌癥的表觀遺傳驅動因素提供了良好的動力隊列。

科研人員提供了譜系特異性和癌癥特異性細胞群的統一圖譜，差異可及的增強子和啟動子，表觀遺傳調節的癌癥相關基因和在主要癌癥轉變中重要的tf。盡管其中一些驅動因素和轉錄程序與多種癌癥類型的轉變有關，但其他一些則表現出高度的癌癥類型特異性。

研究發現，在相同的途徑中，表觀遺傳變化和基因突變之間的相關性在各種癌癥類型中都存在，這表明在癌癥過渡程序中存在許多合作的實例。這項研究強調了tf作為預后標志物的潛力，提供了對驅動癌癥進化的分子基礎的更深入的理解。